عادة ما يتمّ تشخيص الإصابة ب PFIC أثناء فترة الرّضاعة أو الطّفولة وذلك حسب نوع المرض والضّرر الذي سبّبه التّغيير الوراثي الموجود. قد يصطحب الأهل طفلهم الرضيع إلى المستشفى بسبب إصابته باليرقان/ الاصفرار أو الحكّة التي لا تزول. سيحاول الأطباء استبعاد أسباب اليرقان الأخرى الأكثر شيوعاً. قد يوصي طبيب الأطفال بتحويل المريض إلى اختصاصي كبد لإجراء بعض الاختبارات الخاصّة، بما فيها اختبارات الدم أو التّصوير أو أخذ خزعة من الكبد.

عادة يتم تأكيد تشخيص الإصابة ب PFIC بإجراء اختبار وراثي، وهو اختبار يتمّ على عيّنة دم.  قد يساعد الاختبار الوراثي في تحديد الجينات المتأثّرة والمساعدة في تشخيص الإصابة بـ .PFIC

 قد يحدث PFIC بسبب طفرة في جينات مختلفة. فهو مرض وراثي متنحي، ويتوجّب عادة أن يرث الطفل الجين المصاب من الوالدين حاملي المرض (ليسا مصابين فيه).